淳于意从小就爱好医学，他拜淄川人公孙光为师，向他学习医术。公孙光见他十分好学，见解高明，夸奖他日后能成为国医。公孙光把自己的医术和收藏的药方全部传授给淳于意，又推荐他给临淄名医公乘阳庆做了徒弟。当时，阳庆已经八十多岁了，他家里很富有，虽然医术高明，但很少看病，也不收徒弟。淳于意聪明好学，殷勤懂事，对老师侍奉得很周到，阳庆就把黄帝和扁鹤的脉书以及药剂理论全部教给了淳于意。第一年，他学习了老师传授绝他的《脉书》、《上经》、《下经》，对脸色诊病术、听诊术、揆度阴阳术等进行了系统的研究，并在实践中反复琢磨，不断得出自己的见解。到了第二年，淳于意开始试着给人看病，虽然有了效果，但效果还不精到。到了第三年，淳于意开始独立为人治病、判断病人的愈后效果，达到了灵验、精确的程度。他终于学成出徒了。
淳于意医术精湛，决断病人生死多有应验，医治病人能达到起死回生的奇妙效果，人们都说他是神医。一些地方官吏甚至朝廷官员都想把他留在身边专门为官府服务。当时，赵王、胶西王都来请他去。他不肯依附权贵，采取迁移户籍和到全国各地行医的方法来推托。因此，得罪了一些权贵。汉文帝四年(公元前176年)，有人向皇帝告了一状，淳于意被判为肉刑，押解到都城长安。淖于意的小女儿缇萦毅然跟随父亲去了长安，面见文帝，替父亲伸冤。汉文帝下诏免除了淳于意的刑罪，还废除了肉刑。缇萦救父的故事，成为历史上的一段佳话。从此淳于意彻底脱离了官场，专事于一心一意为民行医，救死扶伤的崇高职业。
淳于意活了七十多岁，大约于公元前140年离开了人世。他死后，被安葬在了南依群山，东临时水，风景优美的临淄夏庄村西南。

成就

1.在诊法中重脉诊，同时认为“脉法不可胜验”。强调脉证合参。在25例病案中，其中20例是靠诊脉判定病情的。他应用寸口切脉法。惯常先望诊，后切脉，合参验证，如齐丞相舍人奴的病，“臣意见之食闺门外，望其色有病气。”仓公认为:“古圣人为之脉法，以起度量，立规矩，县权衡、案绳墨、调阴阳，别人之脉各名之，与天地相应，参合于人，故乃别百病以异之，有数者能异之，无数者同亡。然脉法不可胜验，诊疾人以度异之，乃可别同名，命病主在所居。”
2.治疗上针药并用。在淳于意所述治愈的15例病案中，有11例是用药，如用火剂汤(为一种具有清热降气、利小便、通大便的通闭解结剂)治涌疝，热病、风瘅客脬病。用药酒治风蹶、用莨菪药一撮以酒饮之催产，以柔汤治肾濡腰痛、以窜药治月经不调，用芫花一撮饮服驱杀蛲虫，用火剂(米)汁(粥)治洞泄、痹症。此外，尚有两例用针灸治疗，如:“刺足心各三所，案之无出血，”(属于一种补法)。治足心热。还有针灸与外治法合用以及针药并用的治疗案例等，这种疗法都为后世许多医家的经验证明。有其较高的科学性。例如:用凉水拊头、刺足阳明脉左右各三所治郁热上冲。用先灸左阳明经，再服苦参汤治龋齿牙痛。灸足蹶阴之脉左右各一所，用火剂汤治愈气疝。淳于意在其医疗实践中，还针对病因倡导用体育疗法治疗肥胖病，用物理疗法冷敷降温。他反对庸医滥用药、针、灸，坚持反对服石。

淳于意不但是一个著名的医学家，而且是一位热心的教育家。他广收弟子，精心传授。据《史记•扁鹊仓公列传》记载，有宋邑、冯信、唐安、高期、王禹、杜信等人，是秦汉时期文献记载中带徒最多的一位医家，为医学的广泛传播与发展做出了重要的贡献。
医圣张仲景在《伤寒杂病论》序文中说：“上古有神农、黄帝、歧伯；中古有长桑、扁鹊；汉有公乘阳庆、仓公；下此以往，未之闻也。”